肺炎链球菌疫苗是用于对抗肺炎链球菌的疫苗。 疫苗能够有效防止某些肺炎、脑膜炎和败血症。目前有两种肺炎链球菌疫苗：结合型疫苗（Pneumococcal conjugate vaccine, PCV）及多糖体疫苗（Pneumococcal polysaccharide vaccine, PPV） 一般经由肌肉注射或皮下注射给予。

世界卫生组织建议给所有孩童，例行性注射结合型的肺炎链球菌疫苗。 即便是感染人类免疫缺陷病毒的患者也建议施打。一般建议施打三到四剂疫苗，对71%到93%的人能有效防止严重的症状。多糖体疫苗对于健康成人有效，但对两岁以下的孩童以及免疫缺失的患者则没有效果。

肺炎链球菌疫苗一般而言相当安全。 只有将近10%的孩童，在注射结核型疫苗之后，注射处会红肿热痛、发烧(很少超过39度)以及睡眠行为改变。 很少严重过敏。

第一个肺炎链球菌疫苗是在1980年代开发的。 它是世界卫生组织基本药物标准清单的其中之一，意即在基本医疗卫生制度里非常需要、也相当重要的一项药物 2014年的批发价大约是17美金。 在美国售价约25到100美金。